49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1399 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1399  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
331 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0801845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  32.88 
 
 
352 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.65 
 
 
364 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  30.64 
 
 
615 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  28.79 
 
 
354 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  26.62 
 
 
348 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  26.49 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  41.38 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.21 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.81 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.21 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  25.27 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.86 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  40.23 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  35.42 
 
 
412 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.04 
 
 
314 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.1 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  25.13 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  23.85 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  37.36 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.06 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  23.85 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  26.19 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  25.41 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  27.7 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.03 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  24.14 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  35.29 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.85 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.45 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  22.78 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  25.73 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  22.18 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  21.69 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  27.07 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  23.85 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  27.12 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.75 
 
 
271 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  26.06 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>