150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  733    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.84 
 
 
364 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1399  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.9 
 
 
331 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0801845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  27.2 
 
 
615 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  31.14 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  29.07 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  35.11 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  26.77 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  27.35 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  31.22 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  29.36 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  29.36 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  29.36 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  28.94 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  28.04 
 
 
257 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.61 
 
 
275 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  27.53 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.84 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  30.09 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  27.8 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  27.32 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  27.32 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  27.32 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  27.75 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.32 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  27.32 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  27.32 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  32.81 
 
 
257 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 
259 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  24.06 
 
 
309 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  26.83 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.3 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.95 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.78 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  27.8 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  26.85 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  27.96 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  21.94 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  27.44 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  26.74 
 
 
277 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  33.33 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.37 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  30.88 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  26.47 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  27.57 
 
 
314 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.51 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.7 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.18 
 
 
319 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.83 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.32 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  24.17 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  29.38 
 
 
250 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
284 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  27.14 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.98 
 
 
266 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  22.36 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  28.43 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  30.53 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.19 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  23.26 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  24.14 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19620  surface antigen (D15)  26.9 
 
 
904 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  30.77 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  26.47 
 
 
237 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  27.01 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  25.41 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  21.72 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  27.59 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.53 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
289 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  21.07 
 
 
277 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.77 
 
 
264 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.56 
 
 
588 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.68 
 
 
580 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  26.96 
 
 
256 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  27.75 
 
 
256 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  31.09 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.78 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 
594 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  28.68 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  32.14 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  25.75 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  26.79 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>