172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1122 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  42.24 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.77 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  29.83 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  30.32 
 
 		 307 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  29.77 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  29.45 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  29.68 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  28.94 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  27.66 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  27.04 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  26.4 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  25.63 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  32.07 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  24.09 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  29.11 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  29.79 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  30.5 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  29.02 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  23.95 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  29.39 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  28.53 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  28.77 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  28.77 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  27.21 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.76 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  29.31 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28 
 
 		 277 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.08 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.93 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.08 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.08 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.21 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.01 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  28.42 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 559 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  30.04 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  29.92 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  21.59 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.22 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.91 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>