36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4281 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  100 
 
 		 332 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  65.02 
 
 		 335 aa  358  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  41.99 
 
 		 354 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  38.39 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  35.03 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  35.51 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  35.51 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  35.27 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.58 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  35.61 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.53 
 
 		 477 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.81 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.15 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  26.61 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.57 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.46 
 
 		 474 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.37 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  38.96 
 
 		 580 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  34.93 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.09 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  35.65 
 
 		 498 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  28.68 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.05 
 
 		 611 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  28.49 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.19 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  32.39 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  34.13 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  21.39 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>