134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3783 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  41.99 
 
 
332 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  41.8 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  36.81 
 
 
335 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  34.3 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  34.23 
 
 
339 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  34.23 
 
 
339 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  34.16 
 
 
339 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  25.86 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  31.05 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.95 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  34.21 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  25.51 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  25.71 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  25.31 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.9 
 
 
337 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  24.9 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  26.02 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  36.67 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  24.08 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  24.08 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  25.75 
 
 
580 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  26.91 
 
 
496 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  33.6 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  23.5 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  33.63 
 
 
423 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  31.16 
 
 
418 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  23.22 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.37 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  34.51 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  31.11 
 
 
219 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  32.41 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.63 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.2 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.46 
 
 
612 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  31.19 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  24.9 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  31.86 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  30.53 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  31.86 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  29.85 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.43 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  32.52 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  23.74 
 
 
528 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  26.32 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.69 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  30.37 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  30.6 
 
 
218 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  30.6 
 
 
218 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  30.6 
 
 
218 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.87 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.46 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  31.67 
 
 
423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.93 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  34.19 
 
 
376 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  22.74 
 
 
465 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  31.97 
 
 
512 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  28.24 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  30.77 
 
 
423 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  28.24 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.77 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0117  esterase/lipase  23.44 
 
 
570 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1773  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.13 
 
 
533 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  29.1 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  26.76 
 
 
655 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  26.76 
 
 
654 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.48 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  31.15 
 
 
512 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.76 
 
 
654 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  27.61 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0403  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.33 
 
 
588 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.892602  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2035  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0583633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  26.06 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  29.94 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  28.24 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  26.76 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  31.15 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.82 
 
 
655 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  28.15 
 
 
220 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  24.83 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  25.37 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  32.03 
 
 
618 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
634 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.6 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.53 
 
 
655 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.82 
 
 
655 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.29 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2184  hypothetical protein  23.86 
 
 
519 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>