75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3175 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  58.7 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  61.75 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  60.56 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  58.17 
 
 		 275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  36.79 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  38.19 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  30.89 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  30.48 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  35.38 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  35.34 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  35.04 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.06 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  34.2 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  24.56 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  26.34 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  27.18 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.96 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  25.79 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  28.06 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  24.42 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  24.42 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  24.75 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 		 652 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 		 652 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.05 
 
 		 652 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  24.35 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.83 
 
 		 610 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0668  hypothetical protein  23.83 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.78 
 
 		 653 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  24.04 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.51 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.51 
 
 		 419 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.09 
 
 		 594 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.26 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.35 
 
 		 602 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  26.32 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  26.36 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  27.65 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.79 
 
 		 615 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  23.71 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  25.7 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  23.58 
 
 		 638 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  27.48 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.33 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.02 
 
 		 628 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  25.2 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.19 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  23.28 
 
 		 678 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  23.2 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  25.45 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  24.38 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.2 
 
 		 653 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  24.75 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  24.75 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1764  putative hydrolase  35.29 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.51 
 
 		 477 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  31.78 
 
 		 354 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>