209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4585 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  100 
 
 
275 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  55.19 
 
 
283 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  44.66 
 
 
328 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  43.96 
 
 
275 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  42.13 
 
 
275 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  43.38 
 
 
275 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  36.65 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  42.64 
 
 
283 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  34.68 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  39.32 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  35.36 
 
 
308 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  38.89 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  37.65 
 
 
356 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 
281 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  35 
 
 
365 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  38.28 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  30.12 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  35.65 
 
 
325 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  36.55 
 
 
301 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  33.57 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  33.16 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.54 
 
 
310 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 
349 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 
349 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  30.31 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  29.84 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  32.71 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.96 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  30.66 
 
 
351 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  32.11 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  25.3 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.6 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  22.91 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  25.21 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.25 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.25 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.25 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.25 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.41 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.56 
 
 
660 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.3 
 
 
656 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  26.72 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.97 
 
 
721 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.02 
 
 
634 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.3 
 
 
656 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.2 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  32.26 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.33 
 
 
635 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  25.87 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  28.03 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  23.67 
 
 
691 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  28.71 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 
296 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.08 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.33 
 
 
291 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  23.67 
 
 
693 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.1 
 
 
689 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  35.07 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  27.71 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  22.85 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  28.87 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  25.6 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  24.55 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.11 
 
 
678 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.17 
 
 
615 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.59 
 
 
729 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  25.99 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.11 
 
 
651 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6283  Acylaminoacyl-peptidase  28.92 
 
 
641 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0745769  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.11 
 
 
410 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  26.12 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.06 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  26.36 
 
 
632 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.38 
 
 
653 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 
245 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  24.55 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  24.55 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.56 
 
 
317 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.32 
 
 
315 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  27.85 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.91 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  24.46 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.1 
 
 
701 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>