41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4116 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  100 
 
 
335 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  33.75 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  30.06 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  27.17 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  28.75 
 
 
275 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.11 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  25 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  25 
 
 
272 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  25.32 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  28.92 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.67 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  24.12 
 
 
334 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  27.97 
 
 
326 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 
349 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
301 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.67 
 
 
661 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 
283 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.25 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  26.42 
 
 
831 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.48 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.48 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.05 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.1 
 
 
635 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.22 
 
 
697 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  22.12 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.87 
 
 
717 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  28 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  24.11 
 
 
636 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.61 
 
 
628 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  23.43 
 
 
237 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.87 
 
 
518 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>