149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0723 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  80.29 
 
 
281 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  41.92 
 
 
284 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 
275 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  35.97 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  35.34 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  34.95 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  30.26 
 
 
302 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  34.01 
 
 
328 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 
275 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  35.05 
 
 
283 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 
349 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  29.5 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  31.25 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  31.98 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  33.02 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  32.14 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  29.89 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.2 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  28.32 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  26.25 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.19 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.69 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  27.48 
 
 
351 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  25.31 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  24.23 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  26.94 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  24.9 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  28.4 
 
 
414 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  28.65 
 
 
414 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  26.42 
 
 
325 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
335 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  30.61 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  24.53 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  27.81 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  26.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  26.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  26.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  26.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  26.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  32.74 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  26.06 
 
 
345 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  27.41 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  26.67 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  24.86 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  26.39 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  23.53 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.91 
 
 
477 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.12 
 
 
430 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  23.81 
 
 
342 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  25.75 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  26.9 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  25.7 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  25.7 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  29.87 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  28.21 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  23.33 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  26.73 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  24.06 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  26.1 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
291 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  30.51 
 
 
303 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.08 
 
 
355 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  25.36 
 
 
336 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  24.06 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  28.42 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  25.62 
 
 
342 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  26.32 
 
 
414 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  26.71 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  26.71 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 
236 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  23.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.12 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  27 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  30.11 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
683 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>