47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0055 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  100 
 
 		 325 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  76.98 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  76.98 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  53.68 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  49.28 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  36.63 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  35.9 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  34.75 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  34.27 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  35.47 
 
 		 275 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  34.94 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  34.62 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  35.22 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  29.22 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  34.69 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  29.69 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  24.49 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  26.67 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  25.77 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  32.71 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.89 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  30.4 
 
 		 729 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.3 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.9 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.05 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  26.42 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  27.45 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  30.68 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.2 
 
 		 315 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  28.47 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  35.4 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  30.63 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  28.7 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.14 
 
 		 924 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  32.53 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  31.93 
 
 		 423 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  31.17 
 
 		 429 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  31.93 
 
 		 423 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.21 
 
 		 688 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  26.64 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.83 
 
 		 575 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>