193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2471 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 302 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  67.78 
 
 		 301 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  33.66 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  30.26 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  33.57 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  32.5 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  31.66 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  32.27 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  28.34 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  31.09 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  31.09 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  31.61 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.19 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  28.91 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  29.11 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  32.85 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  27.76 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.24 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  28 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  29.07 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  27.18 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  28.79 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  29.83 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  25.65 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  24.36 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  24.55 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  30.15 
 
 		 423 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  28.57 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  25.82 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  25 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.29 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  27.5 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.46 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  24.4 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  25.82 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  27.71 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  25.93 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  28.67 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  24.38 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.83 
 
 		 653 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  27.27 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.66 
 
 		 615 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  30.99 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.68 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.68 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  27.27 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  25.56 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  25.56 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  26.42 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  22.86 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  28.26 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  25.72 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  23.6 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  27.54 
 
 		 356 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  27.68 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  23.48 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.08 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  22.12 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  23.88 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  23.88 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  23.88 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  23.88 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  26.42 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  24.19 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  23.88 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  23.88 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  27.61 
 
 		 841 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  27.84 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  27.54 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>