100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1858 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 275 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  74.91 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  62.95 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  57.14 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  55.56 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  43.63 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  41.37 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  34.82 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  34.87 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  35.5 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  35.47 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 320 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  37.26 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  30.33 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  34.93 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  29.44 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.51 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  30.49 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  29.53 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  27.88 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  28.23 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  24.38 
 
 		 335 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 349 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  26.21 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.64 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  28 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  26.57 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.37 
 
 		 695 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.16 
 
 		 651 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  29.17 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  28.33 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  26.44 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  26.48 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.22 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.99 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 		 653 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.22 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.38 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.22 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.11 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.38 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.78 
 
 		 628 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  31.33 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  27.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  24.89 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1815  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.03 
 
 		 653 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  25.56 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.33 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  24.44 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.89 
 
 		 594 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  24 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  24 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 		 642 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.35 
 
 		 636 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  24 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  24 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  24 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  31.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  27.97 
 
 		 385 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  31.72 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.11 
 
 		 631 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  24 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  24 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.91 
 
 		 656 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  27.97 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  27.97 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.88 
 
 		 587 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  36.11 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  33.09 
 
 		 354 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  31.54 
 
 		 568 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.3 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.3 
 
 		 723 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  24.44 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  24.44 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  24.44 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  24.44 
 
 		 291 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0403  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  46.3 
 
 		 588 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.892602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  36.11 
 
 		 306 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>