60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0677 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  100 
 
 
394 aa  805    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  78.61 
 
 
392 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  73.08 
 
 
392 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  71.03 
 
 
392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  66.04 
 
 
385 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  67.88 
 
 
360 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  69.69 
 
 
328 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  29.55 
 
 
425 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  27.17 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  25.55 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  28.05 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  24.93 
 
 
435 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  25.17 
 
 
316 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.44 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  27.8 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  25.54 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  26.33 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  24.46 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  23.71 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  26.05 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  24.57 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  32.24 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  25.51 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  24.89 
 
 
260 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  21.21 
 
 
459 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0134  hypothetical protein  47.37 
 
 
61 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  36.7 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  30.43 
 
 
651 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  36.7 
 
 
264 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.44 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  23.43 
 
 
710 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.99 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  25.11 
 
 
312 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.73 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  23.86 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  25.54 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  23.32 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.85 
 
 
631 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 
259 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.39 
 
 
669 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  23.39 
 
 
342 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  26.15 
 
 
380 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.65 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.65 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.65 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  26.09 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  27.66 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.33 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.41 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  27.64 
 
 
293 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  30.25 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  23.6 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  26.67 
 
 
580 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  22.36 
 
 
464 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.8 
 
 
277 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  28.27 
 
 
250 aa  43.1  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  34.21 
 
 
735 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  28.67 
 
 
238 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  33.77 
 
 
733 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>