31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2468 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  843    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  46.93 
 
 
435 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  37.7 
 
 
380 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  38.37 
 
 
396 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  30.56 
 
 
374 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  30.74 
 
 
362 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  40.43 
 
 
364 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  27.81 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  30 
 
 
316 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  27.53 
 
 
392 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  30 
 
 
394 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  29.43 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  25.98 
 
 
360 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  26.12 
 
 
385 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  27.18 
 
 
328 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  26.2 
 
 
360 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  25.5 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  23.28 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  23.91 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  22.42 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.11 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  22.49 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  36.25 
 
 
292 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  21.52 
 
 
427 aa  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  22.04 
 
 
710 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  25.31 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.72 
 
 
674 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.72 
 
 
674 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  40 
 
 
313 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  24.75 
 
 
651 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  25.79 
 
 
245 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>