23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3330 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  77.72 
 
 
380 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  49.04 
 
 
364 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  38.25 
 
 
425 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  36.7 
 
 
435 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  26.49 
 
 
362 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24.58 
 
 
374 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  26.48 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  24.46 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  26.06 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  24.65 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  25.31 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.31 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  24.31 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  23.31 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  26.86 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  24.49 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  25.23 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.68 
 
 
633 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  26.77 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  23.57 
 
 
321 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  42.11 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>