62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3838 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  99.17 
 
 		 385 aa  740    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  99.06 
 
 		 328 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  70.14 
 
 		 392 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  68.16 
 
 		 392 aa  544  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  69.58 
 
 		 392 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  67.88 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  27.85 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  26.14 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24.7 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0134  hypothetical protein  82.14 
 
 		 61 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334159 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  26.2 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  24.16 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  22.74 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  26.79 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  23.65 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  24.66 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.44 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  24.65 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.89 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.27 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  23.48 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  24.29 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  30.81 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  26.43 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  22.12 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  26.55 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  26.7 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  34.51 
 
 		 264 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  23.04 
 
 		 260 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  26.06 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  28.49 
 
 		 651 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  25.74 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  22.9 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  23.77 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  24.38 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  27.61 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.73 
 
 		 617 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  26.89 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.25 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  27.61 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  23.04 
 
 		 752 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.83 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.02 
 
 		 724 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.66 
 
 		 735 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  39.19 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  26.99 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  25 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.58 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  21.69 
 
 		 710 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.62 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.89 
 
 		 760 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.3 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.56 
 
 		 721 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  28.48 
 
 		 524 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  34.15 
 
 		 732 aa  42.7  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.23 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>