37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1267 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  33.74 
 
 
292 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  28.34 
 
 
316 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  31.31 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  24.16 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  23.99 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  24.16 
 
 
385 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  23.68 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  22.8 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.46 
 
 
328 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  26.87 
 
 
360 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  23.77 
 
 
425 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  23.71 
 
 
394 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  26.62 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  28.89 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  23.55 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  24.86 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  22.54 
 
 
710 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  23.14 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  21.34 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  22.7 
 
 
399 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  20.83 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  22.54 
 
 
651 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  30.71 
 
 
478 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  25.82 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  24.49 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  27.31 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  29.69 
 
 
449 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1546  hypothetical protein  27.62 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  24.38 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  22.22 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  23.17 
 
 
450 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  45.28 
 
 
561 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  21.02 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  23.38 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>