26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3033 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 		 399 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  39.81 
 
 		 429 aa  328  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  41.31 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  39.25 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  37.5 
 
 		 430 aa  272  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 1564 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  33.85 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  35.47 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  36.51 
 
 		 495 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  32.89 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  34.26 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  32.36 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  29.67 
 
 		 514 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  32.1 
 
 		 397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  24.93 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  25.08 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  24.61 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  28.1 
 
 		 1275 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.71 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 		 2457 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  33.9 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  25.42 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.92 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.37 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.92 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>