25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4328 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1006    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  47.94 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  50.95 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  41.89 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  42.67 
 
 		 1564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  36.41 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  36.51 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  34.24 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  35.4 
 
 		 415 aa  217  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  37.06 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  38.64 
 
 		 437 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  30.77 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  30.55 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  37.14 
 
 		 397 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  30.68 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  29.37 
 
 		 615 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  28.4 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  27.78 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  39.84 
 
 		 1275 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.46 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.26 
 
 		 2457 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  23.7 
 
 		 710 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  27.21 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  54.76 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  28.85 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>