20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2268 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1258    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  46.56 
 
 		 1275 aa  356  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  30.81 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  30.41 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  24.88 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  25.54 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  29.55 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 1564 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  27.45 
 
 		 398 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 2457 aa  91.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  26.82 
 
 		 437 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  25.97 
 
 		 478 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  33.7 
 
 		 429 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  26.5 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  24.93 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  25.92 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  34.81 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  33.12 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  28.74 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  28.24 
 
 		 376 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>