21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0116 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 		 437 aa  882    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  51.49 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  46.42 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  45.2 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 		 1564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  39.25 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  36.32 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  38.26 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  43.16 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  38.54 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  33.92 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  38.64 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  35.75 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  42.86 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  34.18 
 
 		 514 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  26.82 
 
 		 615 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.94 
 
 		 1275 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  33.77 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  31.13 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  25.23 
 
 		 2457 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  23.65 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>