23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2090 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 
397 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  33.59 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  36.1 
 
 
437 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  29.88 
 
 
429 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  32.1 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
1564 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
398 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  31.17 
 
 
415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  31.47 
 
 
450 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  29.76 
 
 
430 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  32.45 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  30.4 
 
 
514 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  31.76 
 
 
449 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  35.02 
 
 
478 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  36.6 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  32.64 
 
 
536 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  35.95 
 
 
1275 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  34.02 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  33.12 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.23 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.96 
 
 
2457 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.5 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  37.29 
 
 
297 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>