20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2279 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 
376 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  38.11 
 
 
421 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  43.95 
 
 
437 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  34.32 
 
 
429 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  34.26 
 
 
399 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  34.22 
 
 
415 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  30.22 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 
1564 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  35.45 
 
 
398 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  36.6 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  31.81 
 
 
495 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  28.03 
 
 
450 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  32.84 
 
 
478 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  32 
 
 
449 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  31.78 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  26.62 
 
 
615 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  27.5 
 
 
536 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  26.11 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  32.03 
 
 
1275 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 
2457 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>