22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3314 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  928    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  44.47 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  38.26 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  32.44 
 
 		 429 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  35.52 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  32.5 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  33.33 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 1564 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  30.77 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  31.36 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  31.47 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  30.9 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  27.47 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  28.39 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  30.77 
 
 		 376 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  25.54 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  25 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  33.33 
 
 		 1275 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  24.27 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.28 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.4 
 
 		 2457 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  25.87 
 
 		 345 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>