21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0219 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 
398 aa  797    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  44.47 
 
 
450 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  33.98 
 
 
429 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  38.54 
 
 
437 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  35.11 
 
 
421 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 
1564 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  34.01 
 
 
415 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  32.36 
 
 
399 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
430 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  38.43 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  35.45 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  30.55 
 
 
495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  30.65 
 
 
478 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  32.66 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  30.42 
 
 
449 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  25.6 
 
 
514 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  28.09 
 
 
1275 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  27.45 
 
 
615 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  38.71 
 
 
536 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.11 
 
 
2457 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.31 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>