22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1505 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  49.39 
 
 
421 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  46.42 
 
 
437 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  41.08 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  39.81 
 
 
399 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  37.68 
 
 
430 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 
1564 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  33.98 
 
 
398 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  34.24 
 
 
495 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  33.83 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  32.44 
 
 
450 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  34.32 
 
 
376 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  34.27 
 
 
514 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  30.75 
 
 
449 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  29.88 
 
 
397 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  39.86 
 
 
1275 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  33.76 
 
 
449 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  34.38 
 
 
536 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  33.7 
 
 
615 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.06 
 
 
381 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  25.84 
 
 
2457 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  21.09 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>