67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2932 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  827    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  23.91 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  23.77 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  26.17 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  23.69 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  26.62 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  26.09 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.48 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  25.81 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  25.51 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  23.48 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  23.48 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  23.75 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  22.36 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  22.81 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  27.07 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  21.82 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  22.18 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  24.67 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.11 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  27.66 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  26.54 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  29.94 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.93 
 
 		 688 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  25.54 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.42 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 1564 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  41.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  38.89 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  29.27 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.53 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  31.9 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 		 706 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  26.84 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  21.09 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  24.82 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  28.37 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  28.85 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  30.71 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  24.69 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  22.22 
 
 		 735 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  25.13 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  32.84 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  27.21 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  27.61 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  42.42 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.01 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  28.46 
 
 		 657 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.23 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  40.43 
 
 		 256 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  22.96 
 
 		 654 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  22.96 
 
 		 655 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  22.96 
 
 		 654 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.01 
 
 		 705 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  22.96 
 
 		 655 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 		 197 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.49 
 
 		 655 aa  43.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  28.23 
 
 		 819 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.82 
 
 		 634 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.35 
 
 		 612 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>