68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4695 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  100 
 
 
406 aa  817    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  43.89 
 
 
434 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  42.78 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  38.97 
 
 
401 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  38.73 
 
 
474 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  38.48 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  36.04 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  38.48 
 
 
420 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  39.53 
 
 
399 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  34.86 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  37.84 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  39.59 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  34.1 
 
 
396 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.47 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  30.77 
 
 
418 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
388 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  31.01 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  25.63 
 
 
402 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  25.63 
 
 
402 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.88 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  30.4 
 
 
403 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.26 
 
 
381 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  32.34 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.97 
 
 
385 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  31.28 
 
 
386 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  28.91 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  31.51 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.69 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  29.87 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  30.29 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  27.06 
 
 
385 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  27.51 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  28.08 
 
 
386 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  28.61 
 
 
400 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  28.61 
 
 
400 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  26.3 
 
 
400 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  31.91 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.6 
 
 
357 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.04 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.94 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  24.67 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.63 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  23.29 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  30.06 
 
 
263 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  24.05 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  29.95 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  33.83 
 
 
326 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  28.21 
 
 
266 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  33.94 
 
 
259 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.77 
 
 
712 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.48 
 
 
807 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  22.14 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36.23 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  26.84 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.16 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
708 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.18 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  30.1 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.43 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  42.42 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  23.08 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  34.58 
 
 
467 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  31.01 
 
 
300 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.31 
 
 
697 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>