28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0584 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  49.86 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  49.72 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  41.4 
 
 		 425 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  34.02 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  27.92 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  29.61 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  28.02 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  29.2 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  30.68 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  26.43 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  26.11 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  26.11 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  27.74 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  25.48 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  35.16 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  40.28 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  43.75 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  31.08 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  32.54 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_744  predicted protein  28.83 
 
 		 675 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0353558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  32.03 
 
 		 651 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  30.68 
 
 		 372 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  36.07 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  38.33 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>