63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3950 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  99.69 
 
 
385 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  99.06 
 
 
360 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  70.55 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  71.34 
 
 
392 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  70.72 
 
 
392 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  69.69 
 
 
394 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  26.14 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  23.8 
 
 
374 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  27.18 
 
 
425 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  26.2 
 
 
316 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  24.46 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  24.67 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  27.4 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  25.87 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  27.27 
 
 
407 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  23.87 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.89 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  24.31 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.27 
 
 
259 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  23.75 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.47 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  24.86 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  22.6 
 
 
459 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  26.55 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  26.43 
 
 
312 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  26.7 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  29.73 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  26.06 
 
 
546 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  23.04 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  34.51 
 
 
264 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  28.49 
 
 
651 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  25.25 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.73 
 
 
617 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  23.77 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  25.84 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.83 
 
 
497 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.66 
 
 
735 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  26.35 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  27.12 
 
 
763 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  24.72 
 
 
752 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  23.66 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  22.56 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.15 
 
 
724 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.38 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.43 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.58 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.25 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.38 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.58 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  39.19 
 
 
741 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.58 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  25.77 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.3 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.12 
 
 
760 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  34.15 
 
 
732 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.58 
 
 
357 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  27.47 
 
 
524 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  22.19 
 
 
710 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  24.04 
 
 
238 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  25.82 
 
 
293 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>