More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1104 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  100 
 
 
752 aa  1562    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  56.11 
 
 
763 aa  850    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  53.71 
 
 
768 aa  857    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  55.25 
 
 
766 aa  837    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  54.95 
 
 
775 aa  847    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  55.97 
 
 
767 aa  848    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  55.67 
 
 
735 aa  884    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  56.11 
 
 
763 aa  849    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  55.25 
 
 
771 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  56.11 
 
 
763 aa  849    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  52.63 
 
 
767 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  55.57 
 
 
748 aa  857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  55.71 
 
 
765 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  44.43 
 
 
751 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  56.25 
 
 
763 aa  851    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  55.69 
 
 
741 aa  874    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  54.37 
 
 
768 aa  849    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  53.73 
 
 
760 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  48.83 
 
 
729 aa  693    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  55.11 
 
 
771 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  47.33 
 
 
741 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  53.87 
 
 
750 aa  854    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  44.8 
 
 
738 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  39.14 
 
 
754 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  36.77 
 
 
812 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  35.23 
 
 
771 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  37 
 
 
733 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  34.38 
 
 
723 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  34.26 
 
 
721 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.87 
 
 
747 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.8 
 
 
739 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  34.91 
 
 
732 aa  361  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.48 
 
 
735 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.57 
 
 
737 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.32 
 
 
724 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  34.13 
 
 
568 aa  326  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  30.22 
 
 
757 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.85 
 
 
721 aa  317  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.23 
 
 
709 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2619  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.17 
 
 
735 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.71 
 
 
740 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1335  peptidase S9, dipeptidylpeptidase  29.84 
 
 
749 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  30.91 
 
 
723 aa  293  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  28.36 
 
 
1006 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.12 
 
 
725 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0755  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.13 
 
 
719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.07 
 
 
693 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3037  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain-containing protein  29.4 
 
 
685 aa  271  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.18 
 
 
711 aa  267  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.76 
 
 
726 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.01 
 
 
732 aa  257  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  29.4 
 
 
683 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.29 
 
 
692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.82 
 
 
718 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  28.51 
 
 
711 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.7 
 
 
732 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1253  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain-containing protein  26.83 
 
 
714 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  28.17 
 
 
689 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02946  Dipeptidyl aminopeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI80]  30.17 
 
 
906 aa  227  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06438  hypothetical dipeptidyl aminopeptidase (Eurofung)  26.88 
 
 
773 aa  220  7e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2692  Dipeptidyl-peptidase IV  26.77 
 
 
772 aa  220  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00660849  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84390  dipeptidyl aminopeptidase B  28.77 
 
 
852 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309155  normal  0.832688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0346  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  29.02 
 
 
764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3764  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.6 
 
 
710 aa  214  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  30.04 
 
 
795 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.02 
 
 
688 aa  211  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01410  dipeptidyl-peptidase and tripeptidyl-peptidase, putative  26.04 
 
 
883 aa  211  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
795 aa  211  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  28.36 
 
 
786 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04186  dipeptidyl peptidase IV  28.86 
 
 
770 aa  203  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.804182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4146  dipeptidyl-peptidase IV  25 
 
 
714 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  28.6 
 
 
831 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01445  peptidase  24.63 
 
 
779 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.02 
 
 
789 aa  185  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1436  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.76 
 
 
776 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  0.0231661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3325  Dipeptidyl-peptidase IV  26.61 
 
 
710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.2 
 
 
828 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01460  peptidase  25.16 
 
 
756 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
826 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3030  Dipeptidyl-peptidase IV  28.04 
 
 
783 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.55 
 
 
827 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
829 aa  178  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
827 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
826 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.75 
 
 
800 aa  170  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  40.45 
 
 
228 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.94 
 
 
826 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 
831 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.08 
 
 
826 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.84 
 
 
826 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  28.31 
 
 
824 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  26.35 
 
 
826 aa  168  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.15 
 
 
850 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  28.31 
 
 
819 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.86 
 
 
826 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.86 
 
 
826 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.84 
 
 
823 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1154  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.89 
 
 
747 aa  158  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.62 
 
 
828 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>