29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0599 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1266    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  30 
 
 
710 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  25.08 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  25.08 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  27.66 
 
 
316 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  31.37 
 
 
345 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  25.66 
 
 
459 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  30.98 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 
394 aa  54.3  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.1 
 
 
708 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.1 
 
 
697 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 
392 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
677 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24.26 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  28.49 
 
 
360 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  28.49 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  24.05 
 
 
425 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  28.19 
 
 
385 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  33.63 
 
 
333 aa  44.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  30.94 
 
 
312 aa  44.7  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.21 
 
 
518 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3664  hypothetical protein  49.02 
 
 
669 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.41 
 
 
424 aa  44.3  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  30 
 
 
741 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  22.13 
 
 
260 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  34.12 
 
 
364 aa  43.9  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
985 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>