79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3562 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 392 aa  806    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  96.43 
 
 		 392 aa  776    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  72.05 
 
 		 392 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  71.03 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  66.75 
 
 		 385 aa  554  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  69.58 
 
 		 360 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  70.72 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  29.67 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  28.65 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24.09 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  25.14 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  27.72 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  26.9 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  29.37 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  23.9 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  26.13 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  25.07 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.41 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  25.09 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  23.58 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0134  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  29.13 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  22.71 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  24 
 
 		 260 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.71 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.16 
 
 		 259 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  28.8 
 
 		 651 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.32 
 
 		 650 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  22.95 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  21.82 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.42 
 
 		 750 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.98 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.34 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  22.45 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  22.71 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.23 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  28.33 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.16 
 
 		 254 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  26.74 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28.09 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  23.56 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.7 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  36.7 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.61 
 
 		 688 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.78 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  29.14 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 		 633 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  24.7 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.18 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  26.77 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.06 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  25.45 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  24.3 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.27 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  25.24 
 
 		 263 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  26.58 
 
 		 662 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  31.43 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  25.87 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24 
 
 		 719 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  26.22 
 
 		 649 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  27.22 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 339 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.22 
 
 		 269 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>