54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2740 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 382 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  61.83 
 
 		 407 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  44.24 
 
 		 459 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  43.54 
 
 		 464 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4084  hypothetical protein  44.44 
 
 		 472 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  26.79 
 
 		 710 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  25.5 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  26.33 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  23.4 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.76 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  26.85 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.86 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  24.86 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  22.41 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  24.29 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  22.95 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  27.1 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28.28 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  27.86 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  29.3 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  27 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  28.26 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  26.21 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  31.15 
 
 		 441 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  31.85 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  29.71 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.97 
 
 		 822 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  26.94 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  25.35 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  24.62 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  27.85 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  29.71 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.92 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  28.67 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  29.5 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  26.35 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  27.86 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  26.61 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  26.11 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  26.21 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  26.9 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  26.9 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  26.21 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.18 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.54 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  25.23 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  26.58 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  25.87 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>