26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2778 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  965    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  61.12 
 
 
459 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4084  hypothetical protein  48.37 
 
 
472 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  46.81 
 
 
407 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  44.57 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  24.44 
 
 
710 aa  66.6  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  25.46 
 
 
392 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  25.09 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  24.88 
 
 
651 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  22.36 
 
 
394 aa  54.7  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  29.73 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  22.19 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  22.48 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.52 
 
 
292 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.37 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  28.37 
 
 
298 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  23.59 
 
 
385 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  29.29 
 
 
968 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  26.71 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  25.69 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.57 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.36 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.58 
 
 
317 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  23.94 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  27.21 
 
 
561 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>