84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3747 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  96.43 
 
 
392 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  100 
 
 
392 aa  805    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  72.31 
 
 
392 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  73.08 
 
 
394 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  70.7 
 
 
385 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  70.14 
 
 
360 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  71.34 
 
 
328 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  27.57 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  29.19 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  23.78 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  25.41 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  28.07 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  25.57 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  24.21 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  28.67 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.55 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  26.83 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  25.22 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  24.03 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  23.28 
 
 
345 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0134  hypothetical protein  47.27 
 
 
61 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  28.85 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  24.44 
 
 
260 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  22.71 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  22.41 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.9 
 
 
326 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.16 
 
 
259 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  28.8 
 
 
651 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.57 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  22.18 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  22.45 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.98 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  26.53 
 
 
290 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  24.65 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.57 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  29.41 
 
 
312 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  26.53 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.14 
 
 
497 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.81 
 
 
247 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  28.33 
 
 
342 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  24.81 
 
 
247 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27 
 
 
750 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.92 
 
 
719 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28.09 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  28.14 
 
 
662 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  22.71 
 
 
657 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.78 
 
 
264 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  26.74 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  29.14 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  36.7 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  23.11 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  26.34 
 
 
649 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.41 
 
 
751 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  22.89 
 
 
652 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
661 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.32 
 
 
615 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
668 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  22.55 
 
 
710 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.41 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  26.37 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
291 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.67 
 
 
657 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
339 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
291 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  25.98 
 
 
291 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  31.43 
 
 
305 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.14 
 
 
694 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.31 
 
 
633 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  34.21 
 
 
241 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.77 
 
 
688 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
305 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  26.92 
 
 
524 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.07 
 
 
661 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>