25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3262 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  900    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  47.29 
 
 
425 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  31.6 
 
 
374 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  36.83 
 
 
380 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  36.7 
 
 
396 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0584  hypothetical protein  35.24 
 
 
364 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  25.54 
 
 
392 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  25.14 
 
 
392 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  22.87 
 
 
392 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  24.66 
 
 
394 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  23.51 
 
 
316 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  22.51 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  22.74 
 
 
360 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.75 
 
 
328 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  24.57 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  22.22 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  27.61 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  23.31 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  24 
 
 
651 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  20.11 
 
 
459 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  21.4 
 
 
399 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  28.32 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  24.84 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  21.44 
 
 
710 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>