29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1726 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1472    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  35.38 
 
 		 651 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  28.61 
 
 		 345 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  26.79 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  26.33 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.38 
 
 		 381 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  23.86 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  28.4 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  24.19 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4084  hypothetical protein  26.02 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  22.04 
 
 		 425 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  23.43 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  22.54 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  23.2 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  23.7 
 
 		 495 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  22.22 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  22.55 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  21.69 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  22.55 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  21.69 
 
 		 385 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  21.75 
 
 		 328 aa  55.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.22 
 
 		 292 aa  54.3  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  27.14 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  22.62 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  27.38 
 
 		 437 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.37 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  24.53 
 
 		 351 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  27.15 
 
 		 333 aa  44.3  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  22.4 
 
 		 298 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>