53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2229 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 441 aa  908    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  64.9 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  48.89 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  30.58 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  27.11 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  26.5 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  29.34 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  27.05 
 
 		 324 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  27.44 
 
 		 329 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  28.48 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  26.92 
 
 		 324 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  26.48 
 
 		 324 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  24.13 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  25.16 
 
 		 323 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  26.69 
 
 		 321 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  25.5 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  25.4 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  28.82 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  27.59 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  27.69 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  26.83 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  26.74 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  26.13 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  26.26 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  24.28 
 
 		 325 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  28.22 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  25.42 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  23.86 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  26.57 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  25.4 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  26.1 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  24.84 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  25.95 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  25.23 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  25.68 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  30.19 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  28.82 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  21.92 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  23.01 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  24.18 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  24.2 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  30.9 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  21.96 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  26.28 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  24.73 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  24.65 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  23.32 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  22.9 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  23.71 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  22.56 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  22.56 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  30.83 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>