60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  609  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  38.52 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  31.31 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  35 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  33.18 
 
 
651 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  29.68 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  30.56 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  28.09 
 
 
425 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  26.43 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  26.43 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  26.43 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 
392 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  24.44 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  25.55 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  28.8 
 
 
399 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  26.84 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.74 
 
 
610 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  50 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3132  hypothetical protein  28.03 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0431256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.6 
 
 
251 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  30.06 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  30.63 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  25.49 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  54 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  30.63 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  25.67 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  32.58 
 
 
323 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  29.78 
 
 
296 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.34 
 
 
631 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  34.78 
 
 
329 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.97 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  28.79 
 
 
407 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  42.42 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  27.68 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  30.82 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  27.22 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  24.86 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  27.81 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  26.88 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  26.88 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  30.37 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.27 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  27.23 
 
 
710 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  50 
 
 
453 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25.6 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.32 
 
 
254 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  25.71 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  26.71 
 
 
230 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.4 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  23.23 
 
 
324 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.4 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>