51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1058 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
323 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  66.16 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  61.66 
 
 
324 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  55.69 
 
 
324 aa  358  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  54.49 
 
 
328 aa  356  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  60.44 
 
 
324 aa  353  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  59.38 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  58.46 
 
 
365 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  59.26 
 
 
324 aa  348  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  56.4 
 
 
350 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  56.54 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  53.23 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  52.92 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  55.62 
 
 
352 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  58.77 
 
 
321 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  51.84 
 
 
329 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  55.84 
 
 
325 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  55.11 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  56.4 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  53.59 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  49.71 
 
 
343 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  54.83 
 
 
419 aa  299  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  50.46 
 
 
328 aa  298  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  53.77 
 
 
327 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  53.09 
 
 
330 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  49.23 
 
 
325 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  50.45 
 
 
332 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  43.98 
 
 
326 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  46.18 
 
 
339 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  49.03 
 
 
320 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  44.13 
 
 
309 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  39.74 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.73 
 
 
333 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.53 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.76 
 
 
321 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  30.42 
 
 
325 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  27.93 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  31.77 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  24.84 
 
 
441 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  30.21 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  25.37 
 
 
454 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.15 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  26.15 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.44 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  26.37 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  27.76 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  48.21 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.01 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>