62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0504 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
329 aa  678    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  73.15 
 
 
325 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  71.6 
 
 
325 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  64.4 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  63.69 
 
 
324 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  65.26 
 
 
328 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  61.73 
 
 
324 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  58.2 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  54.83 
 
 
321 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  57.59 
 
 
321 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  55.38 
 
 
322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  52.62 
 
 
332 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  52.55 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  53.21 
 
 
365 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  51.84 
 
 
323 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  52.45 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  50.46 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  51.39 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  48.13 
 
 
350 aa  311  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  46.75 
 
 
339 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  50.16 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  44.74 
 
 
343 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  50.46 
 
 
328 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  52.63 
 
 
419 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  48.05 
 
 
326 aa  290  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  49.11 
 
 
332 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  47.29 
 
 
352 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  48.35 
 
 
329 aa  272  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  49.54 
 
 
327 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  43.65 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  44.3 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  37.09 
 
 
309 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  36.36 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  33.86 
 
 
321 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.7 
 
 
319 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  32.57 
 
 
319 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.9 
 
 
325 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  29.73 
 
 
432 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  29.25 
 
 
346 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  27.44 
 
 
441 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27.97 
 
 
454 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.64 
 
 
430 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  24.47 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  26.96 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  25.52 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.15 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  25.1 
 
 
402 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  25.44 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.49 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  33.88 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  22.76 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  30.25 
 
 
256 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  36.71 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 
642 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  30 
 
 
653 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  22.76 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  41.27 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  29.7 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  31.34 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  28.99 
 
 
308 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  23.78 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>