62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
365 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  60.86 
 
 
350 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  61.61 
 
 
333 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  57.54 
 
 
324 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  58.46 
 
 
323 aa  349  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  54.15 
 
 
324 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  59.45 
 
 
329 aa  342  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  62.42 
 
 
327 aa  338  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  53.27 
 
 
321 aa  332  8e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  53.21 
 
 
329 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  55.56 
 
 
324 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  52.35 
 
 
328 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  55.11 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  52.74 
 
 
325 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  55 
 
 
321 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  54.01 
 
 
322 aa  315  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  47.66 
 
 
325 aa  308  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  47.66 
 
 
325 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  54.49 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  50.93 
 
 
325 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  50.76 
 
 
328 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  53.99 
 
 
328 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  49.85 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  47.25 
 
 
343 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  51.2 
 
 
332 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  57.28 
 
 
419 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  48.64 
 
 
330 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  46.47 
 
 
339 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  42.3 
 
 
326 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  46.15 
 
 
309 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  48.15 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  41.29 
 
 
320 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  31.53 
 
 
319 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.59 
 
 
321 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.87 
 
 
333 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  30.07 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.35 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  32.28 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.26 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  28.52 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
430 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.48 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  31.68 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  28.24 
 
 
298 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  25.99 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.13 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  29.11 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.67 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.66 
 
 
297 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  31.94 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  29.11 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.3 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  29.53 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.67 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  23.81 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
316 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>