53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  100 
 
 
350 aa  700    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  60.86 
 
 
365 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  60.52 
 
 
333 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  56.4 
 
 
323 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  61.32 
 
 
329 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  53.87 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  56.77 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  49.57 
 
 
324 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  50.58 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  48.13 
 
 
329 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  51.51 
 
 
321 aa  318  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  50.72 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  48.12 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  47.56 
 
 
325 aa  308  8e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  47.56 
 
 
325 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  50.57 
 
 
321 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  47.18 
 
 
328 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  46.94 
 
 
325 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  47.62 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  47.83 
 
 
332 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  48.82 
 
 
419 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  46.46 
 
 
339 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  47.9 
 
 
330 aa  275  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  48.55 
 
 
328 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  46.86 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  45.76 
 
 
332 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  48.12 
 
 
309 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  39.77 
 
 
326 aa  258  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  46.21 
 
 
320 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  36.43 
 
 
320 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  30.41 
 
 
319 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  29.83 
 
 
321 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  29.74 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.93 
 
 
319 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  28.47 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  28.57 
 
 
346 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  32.88 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  30.19 
 
 
441 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27.36 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  26.67 
 
 
430 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.56 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  26.51 
 
 
298 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  27.49 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  27.38 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.67 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.82 
 
 
661 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.51 
 
 
686 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  24.19 
 
 
277 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>