51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3303 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
343 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  80.17 
 
 
339 aa  554  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  51.02 
 
 
324 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  51.17 
 
 
324 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  48.82 
 
 
328 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  50.88 
 
 
322 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  48.68 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  45.61 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  50.73 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  45.32 
 
 
325 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  49.71 
 
 
323 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  48.55 
 
 
333 aa  299  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 
325 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  44.74 
 
 
329 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  49.85 
 
 
324 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  48.12 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  47.25 
 
 
365 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  46.18 
 
 
332 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  46.91 
 
 
350 aa  278  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  47.43 
 
 
330 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  47.52 
 
 
328 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  49.57 
 
 
329 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  44.51 
 
 
325 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  45.09 
 
 
325 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 
352 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  38.37 
 
 
326 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  42.9 
 
 
419 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  42.9 
 
 
327 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  38.12 
 
 
309 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  40.4 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  37.31 
 
 
320 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  29.18 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  32.57 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  28.25 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  27.41 
 
 
325 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  28.14 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  24.5 
 
 
319 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  23.86 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 
432 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  26.84 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  26.83 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  29.08 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  26.6 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.59 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
652 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.6 
 
 
678 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  25.93 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.54 
 
 
678 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  24.83 
 
 
309 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>