48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3115 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
325 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  51.22 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  50.91 
 
 
325 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  51.39 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  52.48 
 
 
321 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  49.53 
 
 
324 aa  316  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  50.93 
 
 
365 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  51.41 
 
 
332 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
324 aa  308  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  46.32 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  49.23 
 
 
323 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  50.16 
 
 
324 aa  298  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  49.85 
 
 
322 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  45.26 
 
 
326 aa  296  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
325 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  51.65 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  48.02 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  47.22 
 
 
321 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  48.77 
 
 
324 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  48.61 
 
 
328 aa  278  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  46.13 
 
 
350 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
328 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  44.51 
 
 
343 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  46.25 
 
 
330 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 
339 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  48.48 
 
 
329 aa  259  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  49.38 
 
 
327 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  48.68 
 
 
419 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  44.41 
 
 
352 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  39.53 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  43.83 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  40 
 
 
320 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  29.9 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  29.77 
 
 
321 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.63 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  28.1 
 
 
325 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  26.14 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  27.78 
 
 
346 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  25.48 
 
 
432 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.83 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  26.16 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  26.64 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  28.84 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  28.29 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.91 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  23.69 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  28.38 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  32.08 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>