58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1231 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
324 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  90.37 
 
 
324 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  71.83 
 
 
324 aa  498  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  65.93 
 
 
328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  62.85 
 
 
325 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  62.54 
 
 
325 aa  431  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  61.73 
 
 
329 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  63.61 
 
 
328 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  63.04 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  59.38 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  60.44 
 
 
323 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  57.85 
 
 
322 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  56.4 
 
 
333 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  57.4 
 
 
330 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  54.37 
 
 
332 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  50.58 
 
 
343 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  55.11 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  53.85 
 
 
325 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  51.18 
 
 
339 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  53.73 
 
 
324 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  50.72 
 
 
350 aa  319  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  49.54 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  55.84 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  53.46 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  50.76 
 
 
332 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  50.16 
 
 
325 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  51.38 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  48.57 
 
 
352 aa  275  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  50.31 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  45.09 
 
 
309 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  40.33 
 
 
320 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.82 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  30.75 
 
 
319 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  31.27 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  30.79 
 
 
321 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.24 
 
 
325 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  29.97 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  27.36 
 
 
432 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  28.15 
 
 
430 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  27.69 
 
 
441 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27.48 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  31.27 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  27.42 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  22.87 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  23.32 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.89 
 
 
617 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.74 
 
 
678 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  21.55 
 
 
402 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  24.28 
 
 
319 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.41 
 
 
673 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.41 
 
 
673 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.41 
 
 
698 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.02 
 
 
698 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  24.39 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.58 
 
 
681 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.71 
 
 
668 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>