36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  100 
 
 		 340 aa  667    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  47.12 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  39.04 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  38.44 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  37.8 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4056  Acetyl xylan esterase  41.84 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  29.17 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  31.31 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  26.5 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  25.8 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  29.37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  30.72 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  28.15 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  29.67 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  24.18 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  29.08 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  24.25 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  28.8 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  29.6 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  28.16 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  27.57 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  23.17 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  30.99 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  28.33 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  28.92 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  23.15 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  27.99 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  27.56 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  23.18 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  27.76 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  29.12 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  26.09 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  25.82 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  28.97 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  26.64 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>