17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2518 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 317 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  57.46 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  56.19 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  42.54 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  39.04 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4056  Acetyl xylan esterase  39.42 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  24.57 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  21.69 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  24.72 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  23.13 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  21.17 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  23.68 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  22.76 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  25.09 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  23.64 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  23.95 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  23.68 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>