56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1848 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  100 
 
 
319 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  48.59 
 
 
319 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  47.02 
 
 
321 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  44.59 
 
 
325 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  31.51 
 
 
346 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  32.34 
 
 
325 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  32.01 
 
 
325 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  31.39 
 
 
324 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  30.92 
 
 
328 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  30.67 
 
 
333 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  32.03 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  31.27 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  32.57 
 
 
329 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  31.77 
 
 
333 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  30.67 
 
 
325 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  29.35 
 
 
365 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  27.93 
 
 
323 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  29.7 
 
 
322 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  30.67 
 
 
419 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  31.65 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  33 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  33.44 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  29.04 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  29.73 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  29.93 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  28.2 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  28.05 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  28.06 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  26.14 
 
 
325 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  26.49 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  27.55 
 
 
328 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  29.61 
 
 
320 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  25.5 
 
 
343 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  27.89 
 
 
329 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  26.99 
 
 
432 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  24.71 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  23.49 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  26.64 
 
 
327 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  25.4 
 
 
441 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  24.71 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  25.71 
 
 
454 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.8 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  21.43 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  19.4 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  24.17 
 
 
319 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  21.69 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  23.83 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  28.49 
 
 
688 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  25.4 
 
 
709 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  27.22 
 
 
744 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.5 
 
 
654 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  21.89 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  25.44 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  28.85 
 
 
690 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.88 
 
 
646 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  27.15 
 
 
719 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>